[Luận văn tiếng Anh] Link prediction in heterogeneous information networks and its applications in predicting associations between non-coding RNAs and diseases
Số trang: 144
Loại file: docx
Dung lượng: 3.61 MB
Lượt xem: 723
Lượt tải: 0
Thông tin tài liệu
CONTENTS
AUTHORSHIP'S DECLARATION ...................................................................... i
ACKNOWLEDGEMENT..................................................................................... ii
CONTENTS ..........................................................................................................iii
ABBREVIATIONS............................................................................................... vi
LIST OF TABLES ............................................................................................... vii
LIST OF FIGURES ............................................................................................ viii
INTRODUCTION ................................................................................................. 1
CHAPTER 1. BACKGROUND .......................................................................... 10
1.1. Basic concepts................................................................................................. 10
1.1.1. Heterogeneous information networks ................................................. 11
1.1.2. Biological systems ............................................................................. 13
1.1.3. Non-coding RNAs (ncRNAs) ............................................................ 14
1.2. Link prediction in heterogeneous information networks .................................. 15
1.2.1. Link prediction problem..................................................................... 15
1.2.2. Link prediction methods .................................................................... 16
1.2.3. Link prediction applications in biological systems ............................. 19
1.3. Computational methods for predicting associations between non-coding RNAs
and diseases ........................................................................................................... 22
1.3.1. Predicting non coding RNA-disease association prediction as a link
prediction problem .......................................................................................... 22
1.3.2. Materials used for ncRNA-disease association prediction .................. 22
1.3.3. Similarity calculation and network construction ................................. 26
1.3.4. Literature review of computational methods to predict ncRNA-disease
associations ..................................................................................................... 27
1.4. Thesis’s research directions ............................................................................. 36
1.5. Some evaluation methods and metrics to evaluate prediction performance ...... 37
1.5.1. Cross-validation ................................................................................. 37
1.5.2. Area under Roc Curve (AUC) ............................................................ 38
Gợi ý tài liệu cho bạn
Gợi ý tài liệu cho bạn
-
Bài tập Xác suất thống kê đại học - có lời giải
200 0 0 -
168 0 0
-
[Mẫu đơn] Cam kết bổ sung chứng chỉ, bằng cấp ứng tuyển vào ngân hàng Vietcombank
587 3 0 -
308 1 0
Gợi ý tài liệu cho bạn
-
145 0 0
-
168 0 0
-
308 1 0
-
Dự án - Thí điểm thiết lập bộ chỉ số đánh giá rủi ro thiên tai cho 1 lưu vực sông
597 0 0 -
Luận văn thạc sĩ_ Nghiên cứu tính năng động cơ DA465QE sử dụng BIOGAS-LPG
580 0 0 -
676 0 0